Machinarium lấy bối cảnh Trái Đất sau ngày tận thế. Khi mà loài người bị diệt vong, và thế giới giờ đây do những con robot làm chủ. Người chơi sẽ vào vai một chàng người máy có tạo hình đáng yêu, lên đường giải cứu bạn bè mình khỏi ách bóc lột tàn bạo của những kẻ cầm quyền.